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崗位職責
一、單細胞測序數(shù)據(jù)分析
1、負責單細胞轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（spatial transcriptomics）、多組學整合數(shù)據(jù)的處理與分析，包括數(shù)據(jù)質(zhì)控（QC）、序列比對、基因表達定量、細胞聚類、差異表達分析及功能注釋。
2、構建細胞類型注釋流程（如使用SingleR、CellID等工具），完成細胞亞群鑒定及細胞發(fā)育軌跡推斷（擬時序分析）。
3、開發(fā)定制化分析腳本（Python/R），支持個性化研究需求（如細胞互作網(wǎng)絡、細胞狀態(tài)轉(zhuǎn)換模型）。
4、 熟悉單細胞ATAC和免疫組庫（TCR/BCR）分析流程。
二、分析流程開發(fā)與優(yōu)化
1、搭建和維護單細胞測序分析標準化流程，整合開源工具。
2、 優(yōu)化算法參數(shù)，提升數(shù)據(jù)處理效率（如并行計算、云計算資源調(diào)度）。
三、生物信息學工具開發(fā)
1、開發(fā)自動化報告生成工具，實現(xiàn)分析結果可視化（R Shiny、Plotly、Dash）。
2、 構建內(nèi)部數(shù)據(jù)庫，管理單細胞公共數(shù)據(jù)集（如HCA、Tabula Sapiens）及公司內(nèi)部實驗數(shù)據(jù)。
四、跨團隊協(xié)作
1、與實驗團隊合作設計測序方案，驗證生物信息學預測結果（如差異基因的qPCR驗證）。
2、為臨床或藥研團隊提供數(shù)據(jù)解讀支持，輸出可落地的生物學洞見。
任職要求
教育背景
生物信息學、計算生物學、統(tǒng)計學、計算機科學或相關領域本科及以上學歷（碩士優(yōu)先）。
技術能力
編程與工具：
精通Python和R語言，熟悉Linux環(huán)境及Shell腳本編程。
熟練使用單細胞分析工具（Seurat、Scanpy、Cell Ranger、STAR、Salmon）。
熟悉生物信息學數(shù)據(jù)庫（NCBI、ENA、Single Cell Portal）及常用算法（UMAP、t-SNE、WGCNA）。
數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗：
至少2年以上單細胞測序數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，完整參與過至少1個單細胞項目（從原始數(shù)據(jù)到生物學結論）。
熟悉單細胞數(shù)據(jù)降噪、批次校正（Harmony、BBKNN）及細胞通訊分析（CellPhoneDB、CellChat）。
加分項：
有多組學（scRNA+ATAC/CITE-seq）整合分析經(jīng)驗。
熟悉云計算平臺（AWS、阿里云）及容器化技術（Docker/Singularity）。
有算法開發(fā)經(jīng)驗（如自定義聚類算法或軌跡推斷模型）。
其他要求
具備快速學習能力，能獨立跟蹤領域前沿技術（如空間多組學、機器學習驅(qū)動的細胞注釋）。
良好的跨學科溝通能力，能將復雜分析結果轉(zhuǎn)化為可理解的生物學結論。
英語熟練，能高效閱讀文獻及技術文檔。
優(yōu)先考慮條件
1、在國際期刊發(fā)表過單細胞相關論文。
2、有藥物研發(fā)背景（如腫瘤微環(huán)境解析、免疫細胞圖譜構建）。
3、熟悉FDA/EMA的生物信息學數(shù)據(jù)提交規(guī)范（如FAIR原則）。